Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CSPP1Q1MSJ5 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms