Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USF2Q15853 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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