Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALX1Q15699 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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