Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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