Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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