Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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