Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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