Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KLF9Q13886 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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