Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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