Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms