Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CUL4BQ13620 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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