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| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.399-201 | ENST00000383955 | 105 nt | BASIC | 5.91 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-128P-201 | ENST00000383976 | 107 nt | BASIC | 5.91 | □□□□□ -1.46 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNA5SP56-201 | ENST00000410277 | 118 nt | BASIC | 5.91 | □□□□□ -1.46 | | |
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| PTK7 | Q13308 | PHC3-217 | ENST00000497658 | 2087 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
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| PTK7 | Q13308 | VCAN-201 | ENST00000265077 | 12625 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AP000943.1-201 | ENST00000438416 | 712 nt | TSL 3 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC012100.2-201 | ENST00000558317 | 304 nt | TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC026464.3-201 | ENST00000563634 | 564 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC087501.4-201 | ENST00000574460 | 235 nt | TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC018695.3-201 | ENST00000602617 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC020910.3-201 | ENST00000603701 | 874 nt | BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC007938.3-201 | ENST00000604965 | 623 nt | BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC097495.1-201 | ENST00000637675 | 546 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.46 | | |
| PTK7 | Q13308 | IGF1-202 | ENST00000337514 | 7359 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | CRISP1-201 | ENST00000329411 | 1709 nt | TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | FGF1-202 | ENST00000359370 | 3660 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC007750.1-202 | ENST00000418968 | 4098 nt | TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF33B-208 | ENST00000613419 | 5843 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | RYR3-209 | ENST00000634418 | 15078 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC008695.1-201 | ENST00000514667 | 6393 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | MYBPC1-221 | ENST00000551300 | 3934 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | CEP83-202 | ENST00000397807 | 2737 nt | TSL 5 BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | MTND4P1-201 | ENST00000457501 | 1466 nt | BASIC | 5.9 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | XPNPEP3-201 | ENST00000357137 | 7988 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF383-201 | ENST00000352998 | 6760 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL359922.3-201 | ENST00000624779 | 1670 nt | BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF189-201 | ENST00000259395 | 3115 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | ATXN3L-201 | ENST00000380622 | 2164 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | USP15-201 | ENST00000280377 | 4748 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | KMT5B-215 | ENST00000615954 | 4306 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5-8SP7-201 | ENST00000363443 | 155 nt | BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-701P-201 | ENST00000384059 | 107 nt | BASIC | 5.89 | □□□□□ -1.47 | | |