Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms