Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTGDRQ13258 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTGDRQ13258 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTGDRQ13258 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTGDRQ13258 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTGDRQ13258 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTGDRQ13258 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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