Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SRSF5Q13243 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms