Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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