Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms