Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TRDNQ13061 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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