Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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