Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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