Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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