Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRGP23470 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRGP23470 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms