Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPRDP23468 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPRDP23468 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPRDP23468 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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PTPRDP23468 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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PTPRDP23468 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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PTPRDP23468 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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