Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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