Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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