Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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HOXD1Q9GZZ0 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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