Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGGTAQ92696 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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