Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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