Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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RAB39AQ14964 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RAB39AQ14964 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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