Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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