Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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