Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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