Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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UBE4AQ14139 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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UBE4AQ14139 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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UBE4AQ14139 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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UBE4AQ14139 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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UBE4AQ14139 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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