Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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