Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms