Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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