Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SEMA3FQ13275 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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