Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms