Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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