Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PRDM2Q13029 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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