Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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