Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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