Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EBF1Q9UH73 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms