Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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