Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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