Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms