Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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