Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD1Q8NHV4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms