Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ZBED9Q6R2W3 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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