Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SLC27A3Q5K4L6 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms